來源:賢集網(wǎng) 時間:2021-07-08
人類基因組測序耗時 13 年,耗資 10 億美元,這是一項巨大的科學事業(yè),開啟了醫(yī)學新時代。隨著當今測序技術的進步,同樣的任務只需花費大約一天的時間,成本只是其中的一小部分。明天的技術可以將其減少到僅僅幾秒鐘。
基于納米孔的 DNA 測序是第三代技術,有可能通過提供疾病的快速診斷和個性化醫(yī)療來進一步改變醫(yī)療保健。方法越有效越好。雖然公司已經(jīng)開始將該技術商業(yè)化,但仍有一些障礙需要克服。
MXene 卓越的機械性能、熱穩(wěn)定性和化學穩(wěn)定性使其成為固態(tài)納米孔 DNA 測序的有力選擇。
圖片來源:卡內(nèi)基梅隆大學工程學院機械和人工智能實驗室
目前使用的一種納米孔方法是基于蛋白質(zhì)的,即生物的。它使用能夠區(qū)分單個核苷酸和一組核苷酸的膜蛋白復合物。不幸的是,蛋白質(zhì)會因測序所需的大量使用而分解——對于納米孔膜來說,這可能是數(shù)百萬次。
相比之下,固態(tài)納米孔測序使用合成材料。二維納米材料,如石墨烯、氮化硅和二硫化鉬,提供了卓越的機械性能和熱和化學穩(wěn)定性。但是,這種方法仍然存在缺點??茖W家需要進一步研究以更好地理解和表征這些不同的固態(tài)材料。
卡內(nèi)基梅隆大學的研究人員對另一種納米材料 MXene 合成的最新進展產(chǎn)生了興趣。也稱為碳化鈦,它屬于一類單層、二維無機化合物,只有幾個原子厚。以前沒有人將這種材料用于納米孔 DNA 測序。研究結果發(fā)表在ACS Nano雜志上。
MXenes 以其結合了金屬和陶瓷的特性而著稱,包括出色的導熱性和導電性、耐熱性、易加工性和出色的體積電容。
研究人員希望探索 MXene 作為用于 DNA 檢測的潛在膜材料,并觀察它如何與其他納米材料進行測量。為了進行調(diào)查,他們使用分子動力學模擬來分析其與單鏈 DNA 的相互作用。他們測量了物理特征,例如離子電流、停留時間、DNA 堿基的痕跡、物理吸附、堿基的柔韌性和納米孔的水合作用。
一個納米孔陣列可以包含數(shù)百個直徑小于 8 納米的孔。
“如果納米孔太大,所有遺傳物質(zhì)都會通過膜混合在一起,”機械工程助理教授 Amir Barati Farimani 解釋說:“太小了,根本就過不去?!?nbsp;
該團隊發(fā)現(xiàn),基于 MXene 的納米孔能夠以高靈敏度檢測不同類型的 DNA 堿基。
“我們證明 MXene 是一種有效且有前途的納米材料,可用于基于納米孔的檢測平臺,”Barati Farimani 說。
研究人員旨在通過利用強大的人工智能 (AI) 算法來改進納米孔系統(tǒng)的 DNA 檢測來擴展他們的工作。DNA 堿基具有獨特的特征,可用作訓練 AI 的輸入,以提高 DNA 檢測的準確性。而且,人工智能可以利用高維模擬數(shù)據(jù)來學習和提取最重要的特征來區(qū)分 DNA 堿基。
“這項工作的擴展有望極大地改進基于納米孔的檢測平臺,并最終克服使這項技術廣泛適用的門檻,”Barati Farimani 說。
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