來源：科技部        時間：2021-01-06

       近年來隨著DNA測序技術(shù)的蓬勃發(fā)展，蛋白質(zhì)結(jié)合位點的高通量鑒定、染色質(zhì)可及性及甲基化狀態(tài)分析等檢測技術(shù)不斷涌現(xiàn)，其中很多技術(shù)（如DNase-seq和ATAC-seq等）依賴于開放性染色質(zhì)對轉(zhuǎn)座酶等的敏感性。在這些新技術(shù)中，全基因組核小體定位及DNA甲基化組測序技術(shù)（NOMe-seq）能夠利用外源性M. CviPI GpC甲基轉(zhuǎn)移酶標(biāo)記基因組可及性區(qū)域，結(jié)合亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)換，NOMe-seq能夠同時檢測內(nèi)源性胞嘧啶甲基化和核小體開放性狀態(tài)。 　　

       納米孔測序（Nanopore sequencing, 又稱第四代測序）是近年來興起的新一代單分子測序技術(shù)，具有測序讀長（reads）長（>150 kb），速度快，測序數(shù)據(jù)實時監(jiān)控，機器方便攜帶等優(yōu)點。之前研究已證明納米孔測序能夠檢測內(nèi)源性CpG甲基化，并能對酵母甚至人類細胞的染色質(zhì)可及性位點進行外源標(biāo)記。 　　

       2020年11月23日，約翰霍普金斯大學(xué)Winston Timp教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團隊在Nature Methods雜志發(fā)表了題為“Simultaneous profiling of chromatin accessibility and methylation on human cell lines with nanopore sequencing”的研究論文，作者通過GpC甲基轉(zhuǎn)移酶外源性標(biāo)記開放染色質(zhì)后，利用納米孔測序技術(shù)（nanoNOMe-seq）同時檢測了人類細胞中的內(nèi)源性CpG甲基化狀態(tài)和染色質(zhì)可及性的階段性模式，構(gòu)建了涵蓋甲基化和染色質(zhì)開放性信息等在內(nèi)的人類細胞表觀基因組，并利用該技術(shù)揭示了乳腺癌細胞和非癌細胞間的表觀遺傳差異。nanoNOMe-seq為我們揭示人類發(fā)育與疾病發(fā)生中復(fù)雜的染色質(zhì)表觀遺傳學(xué)特征提供了新的技術(shù)支持。 

       論文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41592-020-01000-7